סיבה שנייה היא מחסור בחנקן. אפונה היא קטנית שיוצרת קשרי גומלין עם חיידקים מקבעי חנקן, אבל באדמה דלה או בעציץ ללא חיידקים מתאימים, העלים התחתונים מצהיבים והצמיחה נעצרת. הפתרון: דשן אורגני עשיר בחנקן כמו קומפוסט או זבל עוף מותסס, או הוספת תכשיר חיידקי ריזוביום ספציפי לאפונה. דישון חנקני מינרלי עדיף להימנע כי הוא פוגע בקשרי הגומלין.
סיבה שלישית: ניקוז לקוי או דחיסות קרקע. אם האדמה חרסיתית או שהעציץ חסר חורי ניקוז, המים עומדים וגורמים לחנק שורשים ולהצהבה. הפתרון: שפר ניקוז על ידי ערבוב חול גס או פרלייט באדמה, ובעציצים וודא שיש לפחות 3 עד 4 חורים בתחתית. אם הצמח כבר סובל, העבר אותו למקום עם ניקוז טוב יותר.
סיבה רביעית היא חוסר אור. אפונה זקוקה לשמש מלאה (6 עד 8 שעות ביום) כדי לבצע פוטוסינתזה תקינה. בצל חלקי, העלים מאבדים את צבעם הירוק ומצהיבים. הפתרון: העבר את העציץ או זרוע מחדש במיקום שטוף שמש. בישראל, ערוגות הפונות דרום-מערב הן אידיאליות בחורף. בנוסף, בדוק עלים תחתונים צהובים, אם הם יבשים בקצוות, ייתכן שזה מחסור באשלגן: הוסף דשן אורגני עשיר באשלגן כמו אשלגן גופרתי אורגני לפי הוראות היצרן.
