באביב, מיד אחרי שתילת השתילים, השקה בעדינות פעם ביומיים-שלושה, כ-1 עד 2 ליטר לצמח, כדי לעודד התבססות שורשים. המצע צריך להיות לח אך לא רטוב, בדוק באצבע בעומק 5 ס"מ.
בקיץ הישראלי החם, הפלפל זקוק להשקיה תכופה יותר: כל יום-יומיים, כ-3 עד 4 ליטר לצמח בוגר. השקה בשעות הבוקר המוקדמות או הערב כדי להפחית אידוי. אם העלים נובלים בצהריים, זה סימן לחוסר מים; עלים מצהיבים ונשירים מעידים על עודף מים.
בסתיו, עם ירידת הטמפרטורות, הפחת בהדרגה ל-2 עד 3 ליטר כל 3 עד 4 ימים. בחורף, כשהצמח רדום יחסית, השקה במשורה, פעם בשבוע, כ-1 ליטר, ורק אם אין גשם משמעותי. הימנע מהשקיית יתר הגורמת לריקבון שורשים.
כדי לדייק, השתמש במד לחות קרקע או בתקיעת אצבע: אם האדמה יבשה בעומק 3 עד 5 ס"מ, הגיע זמן ההשקיה. עדיף השקיה עמוקה וארוכה על פני השקיות שטחיות תכופות, זה מעודד שורשים עמוקים ועמידים יותר.
