גיזום עגבנייה בישראל מתבצע בשני מועדים עיקריים: גיזום ראשוני כשבועיים לאחר השתילה (באפריל-מאי), וגיזום תחזוקתי שוטף לאורך כל עונת הגידול (מאי עד אוקטובר). הגיזום הראשוני נועד לעודד התפתחות גבעול מרכזי חזק ולהסרת ענפים צדדיים תחתונים. הגיזום השוטף כולל הסרת 'עיניים' (נצרים צדדיים) בחיקי העלים, עלים תחתונים מצהיבים ופרחים או ענפים חולים.
הטכניקה פשוטה: אחזו בעדינות בנצר הצדדי (העין) בין האגודל והאצבע, וצבטו אותו החוצה. לעלים וענפים עבים יותר השתמשו במספרת גיזום חדה ומחוטאת. חתכו בזווית של 45 מעלות, כ-5 מ"מ מעל צומת העלה. לעולם אל תחתכו את הגבעול הראשי מעל האשכול הפורח האחרון – זה יפגע בצמיחה וביבול. השאירו 2-3 ענפים צדדיים חזקים לצמח שיחי, או גזמו לענף אחד (שיטה מומלצת לעגבניות שרי).
מה לא לחתוך? לעולם אל תסירו עלים מעל אשכול הפירות המבשיל – הם חיוניים לפוטוסינתזה ולהבשלת העגבניות. גם אל תגזמו בימים חמים מאוד (מעל 35°C) או מיד לאחר השקיה, כדי למנוע סטרס מיותר ומחלות פטרייתיות. כדאי לגזום בשעות הבוקר המוקדמות, כשהצמח טורגור מלא והפצעים מתייבשים במהירות.
בישראל, גיזום קיצי (יוני-אוגוסט) דורש תשומת לב מיוחדת: הסירו עלים תחתונים החשופים לאדמה כדי למנוע הדבקות בטחב וריקבון, אך השאירו כיסוי עלים מספק להגנה מקרני השמש העזה. בסוף העונה (ספטמבר-אוקטובר) כדאי 'לצבוט' את קצה הגבעול הראשי, כחודש לפני הכפור הראשון, כדי לנתב את האנרגיה להבשלת הפירות הקיימים.
