כדי לאבחן, חפור בעדינות ליד השורשים. ריקבון שורשים מתבטא בשורשים חומים, רזים ורכים, לעיתים עם ריח רע. לעומת זאת, שורשים בריאים לבנים ומוצקים. אם האדמה כבדה ומנוקזת גרועה (למשל, אדמת חרסית), הסיכון לריקבון גבוה יותר. בישראל, בעונות הגשומות או כשמשקים יתר על המידה, הבעיה נפוצה. בדוק גם את העלים התחתונים: הצהבה ונשירה אופיינית לעודף מים.
אם אובחן ריקבון שורשים, הפסק מיד את ההשקיה ואפשר לאדמה להתייבש. הסר את הצמח מהעציץ או מהערוגה, גזום שורשים רקובים (חום ורך) בעזרת מספריים נקיים, ושתל מחדש במצע חדש ומנוקז היטב (תערובת של אדמת גינה, קומפוסט וחצץ). אם הצמח גדל באדמה כבדה, העבר אותו לערוגה מוגבהת או לעציץ גדול עם חורי ניקוז. הימנע מהשקיה עד שהאדמה יבשה בעומק 5 ס"מ.
אם הצמח צמא באמת, השקה מיד עד שהמים יוצאים מחורי הניקוז, ואז המשך להשקות בתדירות רגילה: בקיץ בישראל, השקה כל 2-3 ימים לעומק של 15-20 ס"מ. הוסף שכבה של 5 ס"מ קומפוסט או קש מסביב לבסיס הצמח לשמירת לחות. כדי למנוע הישנות, שתול עגבניות באדמה מנוקזת היטב, הימנע מהשקיית יתר, והקפד על מרווח של 50-60 ס"מ בין צמחים לאוורור טוב.