אקריות (Spider mites) תוקפות בעיקר בקיץ החם והיבש. הן גורמות לנקודות צהובות על העלים ולקורי עכביש דקים. טיפול: ריסוס במים חזק להסרת קורים, או שימוש בשמן נים (5 מ״ל לליטר) או בחומץ תפוחים מדולל (1:10). מניעה: שמירה על לחות סביב הצמח על ידי חיפוי קרקע (קש או רסק) והשקיה סדירה.
מחלות פטרייתיות כמו טחב אבקתי (Powdery mildew) וריקבון חום (Blossom end rot) נפוצות בסוף הקיץ. טחב אבקתי נראה כציפוי לבן על העלים, ומטופל בתערובת סודה לשתייה (1 כפית לליטר מים) עם מעט סבון. ריקבון חום נובע מחוסר סידן והשקיה לא סדירה. טיפול: הסרת פירות נגועים, השקיה קבועה (3 עד 4 פעמים בשבוע בקיץ) והוספת קומפוסט עשיר בסידן.
מחלת הנבול (Fusarium ו-Verticillium) תוקפת דרך הקרקע וגורמת לעלים מצהיבים ולנבילה. אין טיפול כימי יעיל; מניעה: שתילת זנים עמידים (מסומנים באותיות VF), חיטוי כלי גיזום, ומחזור זרעים של 4 שנים לפחות. אם הצמח נפגע, הוציאו אותו מיד ואל תשתלו עגבניות באותו מקום בשנה הבאה.
