כדי לאבחן, חפור בעדינות ליד צוואר השורש. אם השורש חום, רך או בעל ריח רע – זה ריקבון. במקרה כזה הפסק מיד את ההשקיה, חשף את צוואר השורש לאוויר על ידי גירוד קל של האדמה, ואם המצע כבד, שקול להעביר את הצמח לאדמה מנוקזת היטב (תערובת 50% אדמה, 30% חול, 20% קומפוסט).
אם השורש לבן-כתום מוצק והאדמה יבשה מתחת לפני השטח – הגזר סובל מצמא אמיתי. השקה מיד בעומק (עד 15 ס״מ) פעם ביומיים-שלושה בקיץ, פעם בשבוע בחורף. הוסף שכבה של 2-3 ס״מ קומפוסט או קש על פני האדמה לשמירת לחות, ואל תשקה שוב עד שהשכבה העליונה מתייבשת.
בישראל, גזר סגול רגיש לחום קיצוני – בקיץ חם מ-35°C הוא עלול לנבול גם עם השקיה מספקת. הצל את הערוגה ברשת הצללה 30% בשעות 11:00-15:00, או שתל בעציץ שניתן להזזה. השקה תמיד בבוקר ולא בערב כדי למנוע מחלות פטרייתיות.