בישראל, הזמן האידיאלי לגיזום רימון הוא בחורף, לאחר נשירת העלים ובעוד העץ בתרדמה (דצמבר-פברואר). גיזום בתקופה זו ממזער אובדן מוהל ומאפשר ריפוי מהיר. הימנע מגיזום באביב או בקיץ, שכן הדבר עלול לגרום לדימום מוהל ולפגיעה בפרי.
התחל בהסרת ענפים יבשים, חולים או פגועים. לאחר מכן, דלל ענפים צפופים כדי לאפשר חדירת אור ואוויר למרכז העץ. קצר ענפים ארוכים מדי ב-1/3 עד 1/2 מאורכם, תוך חיתוך מעל ניצן הפונה החוצה. שמור על 3 עד 5 ענפים ראשיים (שלד) ועל צורה פתוחה בצורת אגרטל.
בשנים הראשונות, גיזום מעצב חשוב: בחר 3 עד 5 ענפים עיקריים בתחתית הגזע, קצר אותם בשליש, והסר ענפים מתחרים. בגידול בוגר, גיזום תחזוקה שנתי כולל הסרת שלוחות שורש (מלכות) מבסיס העץ ודילול ענפים פנימיים. כלים: מזמרה חדה ומנוקה, מסור לענפים עבים.
מה לא לחתוך? אל תקצר ענפים שנושאים פרי (ענפים קצרים בני שנה-שנתיים), הפירות יופיעו על קצותיהם. הימנע מגיזום כבד יותר מ-30% מהעץ בשנה אחת, כדי לא לגרום לצמיחה וגטטיבית מופרזת על חשבון הפרי. חיטוי הכלים בין חיתוך לעץ חולה מונע הפצת מחלות.
