בליצ'י נפוצות במיוחד כנימות העלים והאקריות (קרדית). הכנימות מופיעות באביב ובקיץ על עלים צעירים וניצנים, וגורמות לעיוותים ולהפרשת דבש שמזמין פטריית פייחת. האקריות, בעיקר אקרית הליצ'י (Aceria litchii), תוקפות עלים ותפרחות ויוצרות גַּלִּים (עיבויים מעוותים). כדי לטפל, יש לרסס בתערובת של סבון רך (20 מ"ל לליטר מים) ושמן נים (10 מ"ל לליטר) כל 7 עד 10 ימים, עד להיעלמות המזיק. מומלץ לרסס בשעות הבוקר המוקדמות או אחר הצהריים המאוחרים כדי למנוע צריבת עלים.
מחלות פטרייתיות כמו ריקבון שורשים (פיתיום, פוסריום) וריקבון פירות (קולטוטריכום) פוגעות בליצ'י בעיקר בעונת הגשמים או בהשקיית יתר. ריקבון שורשים מתבטא בהצהבת עלים ונבילה, ואילו ריקבון פירות גורם לכתמים חומים-שחורים על הקליפה. המניעה הטובה ביותר היא ניקוז מעולה (הימנע משתילה באדמה כבדה) והשקיה מבוקרת, השקה רק כשהאדמה יבשה בעומק 5 ס"מ. במקרה של התפרצות, הסר פירות וענפים נגועים ומרסס בתכשיר נחושת (לפי הוראות התווית) או בתמיסה של סודה לשתייה (1 כפית לליטר מים) פעם בשבוע למשך 3 שבועות.
מזיק נוסף הוא זבוב הפירות הים-תיכוני, התוקף פירות מבשילים ומטיל ביצים מתחת לקליפה. הזחלים גורמים לריקבון פנימי ולנשירת פירות. כדי להימנע, יש לקטוף פירות כשהם עדיין קשים מעט (ורודים אך לא רכים) ולכסות את העץ ברשת צל 30% בתקופת ההבשלה (יוני-אוגוסט). בנוסף, תלה מלכודות פרומון או מלכודות צהובות דביקות בגובה העץ (2 עד 3 מלכודות לעץ בינוני) להקטנת האוכלוסייה.
חשוב לזכור: ליצ'י רגיש לעודף דשן חנקני, שמחליש את העץ ומזמין מזיקים. השתמש בדשן מאוזן (NPK 8 עד 8-8) פעם בחודש בעונת הגידול (אביב-קיץ), והפסק חודש לפני הקטיף. גיזום אוורור שנתי בסוף החורף (פברואר-מרץ) מסייע להחדרת אור ואוויר, ומונע התפתחות פטריות. אם העץ נגוע קשה, התייעץ עם אגרונום, לעולם אל תשתמש בחומרי הדברה כימיים בלי הכוונה מקצועית.
