פלפל חריף, שמו המדעי Capsicum annuum, הוא צמח עמיד יחסית, אך אינו חסין מפני מזיקים ומחלות נפוצות בגינה הישראלית. המזיקים הנפוצים ביותר הם כנימות, אקריות (קרדית אדומה) ותריפס. הכנימות מופיעות כמושבות קטנות על עלים צעירים וגבעולים, וגורמות לעיוותים ולהפרשת טל דבש שמזמין פטריות. אקריות מופיעות בתנאי יובש וחום ומשאירות עלים מנוקדים וצהבהבים. תריפס גורם לפסים כסופים על העלים ולעיוות של פרחים ופירות קטנים.
מבחינת מחלות, הריקבון האפור (Botrytis) מופיע בתנאי לחות גבוהה ומתבטא כעובש אפור על פרחים ופירות. טחב אבקתי נראה כמו אבקה לבנה על העלים, בעיקר בעונות המעבר. מחלות קרקע כמו ריקבון שורש (Pythium, Fusarium) תוקפות כשהאדמה כבדה וחסרת ניקוז. כדי למנוע אותן, הקפידו על אדמה מנוקזת היטב ועל השקיה ישירה לשורשים, לא לעלים.
לטיפול אורגני בכנימות, תריפס ואקריות, רססו תמיסת סבון רך (כף סבון כלים נוזלי עדין בליטר מים) פעם ב-3 ימים למשך שבועיים. אפשר גם להשתמש בשמן נים, 5 מ"ל לליטר מים, פעם בשבוע. נגד טחב אבקתי וריקבון אפור, רססו תמיסת סודה לשתייה (כפית סודה בליטר מים) או חלב (1:9 עם מים). חשוב לטפל מיד עם הופעת הסימנים הראשונים.
מניעה היא המפתח: שתלו פלפלים במרחק 40 עד 50 ס"מ זה מזה לאוורור טוב, השקו בשעות הבוקר המוקדמות, והימנעו מהרטבת עלים. גידול לצד ציפורני חתול או בזיליקום דוחה מזיקים. אם המזיקים חוזרים, שקלו לשלב טורפים טבעיים כמו כנימת המחץ (Aphidius) או קרדית טורפת (Amblyseius). זכרו: חומרי הדברה כימיים פוגעים גם בחרקים מועילים, הקריאו תמיד את התווית אם אתם בוחרים להשתמש בהם.





