גרגיר הנחלים, הגדל במים או באדמה לחה, רגיש למזיקים מוצצי מוהל כמו כנימות שחורות וירוקות. הכנימות מתרכזות בצד התחתון של העלים ובצמיחה החדשה, וגורמות לעיוות עלים ולהפרשת דבש שמזמין פטריית יינוק. בנוסף, אקריות (קרדיות) זעירות מופיעות בתנאי יובש, וגורמות לעלים להצהיב ולנשור. גידול בתנאי לחות גבוהה עלול לעודד ריקבון שורשים ופטריות כמו טחב פלומתי, המתבטא בכתמים צהבהבים על העליון וציפוי אפור בתחתית.
לטיפול בכנימות ובאקריות, השקה חזקה של מים על העלים מסלקת חלק מהן. לריסוס אורגני יעיל, ערבבו כפית סבון כלים נוזלי (ללא חומרי ריכוך) בליטר מים ורססו על העלים, במיוחד בצד התחתון. חזרו על הפעולה כל שלושה ימים עד להעלמות המזיקים. לטיפול בפטריות וריקבון, יש להקפיד על מרווחים בין הצמחים לאוורור טוב, ולהימנע מהשקיית יתר. אם מופיע ריקבון שורשים (שורשים חומים ורכים), הפסיקו להשקות זמנית ושפרו ניקוז. ריסוס בתמיסת סודה לשתייה (כפית לליטר מים) מסייע נגד טחב פלומתי.
מניעה היא המפתח: שתלו גרגיר נחלים במים זורמים נקיים או באדמה מנוקזת היטב, ושמרו על ניקיון סביב הצמח. הסירו עלים נגועים מיד ואל תשאירו צמחייה מתה בקרבת מקום. גידול במקום מואר (לפחות 4 עד 6 שעות שמש ביום) מחזק את הצמח ומפחית רגישות למחלות. הימנעו מדישון יתר בחנקן, המעודד צמיחה רכה ופגיעה יותר.
חשוב: לעולם אל תשתמשו בחומרי הדברה כימיים על גרגיר הנחלים, כיוון שהוא נאכל טרי ועלול לספוג שאריות רעילות. כל התכשירים האורגניים המוזכרים בטוחים לשימוש, אך יש לקרוא תמיד את הוראות היצרן. אם ההדבקה חמורה, עדיף לעקור צמחים נגועים ולשתול מחדש במקום נקי.
