עץ התפוח, בהיותו נשיר, זקוק לכמויות מים משתנות לאורך השנה. בקיץ הישראלי החם והיבש (יוני-ספטמבר), השקיה תכופה ועמוקה היא הכרחית. השקה את העץ פעמיים בשבוע, ובגלי חום קיצוניים אף שלוש פעמים. כמות המים לכל השקיה צריכה להיות כ-40 עד 60 ליטר לעץ בוגר (תלוי בגודלו ובסוג הקרקע), כך שהמים יחדרו לעומק 40 עד 60 ס"מ לפחות. השקה סביב אזור ההשרשה, הרחק מהגזע, כדי לעודד התפתחות שורשים עמוקים.
באביב (מרץ-מאי) ובסתיו (אוקטובר-נובמבר), כשהטמפרטורות מתונות יותר, ניתן לצמצם להשקיה אחת לשבוע, כ-30 עד 40 ליטר לעץ. בחורף (דצמבר-פברואר), כשהעץ בתרדמת, כמעט ואין צורך בהשקיה מלאכותית, אלא אם ישנה בצורת ממושכת. גשמי החורף בישראל מספיקים בדרך כלל, אך אם אין גשם במשך שבועיים, השקה קלה של 20 ליטר פעם בשבועיים תמנע ייבוש יתר של השורשים.
סימני חוסר מים כוללים עלים נבולים, שמוטים ומצהיבים, ופרי קטן או נושר בטרם עת. לעומת זאת, עודף השקיה מתבטא בעלים צהובים עם ורידים ירוקים, ריקבון שורשים, ואדמה בוצית וריחנית. בדוק את רטיבות המצע בעזרת מקל עץ: הכנס לעומק 20 עד 30 ס"מ, אם יוצא עם אדמה דביקה, דחה השקיה; אם יבש, השקה. חיפוי הקרקע בקומפוסט או קש מסייע לשמירת הלחות ולמניעת אידוי.
זנים שונים עשויים להיות רגישים מעט יותר או פחות לעודף מים, אך העקרונות דומים. התאם את ההשקיה גם לסוג הקרקע: קרקע חולית מנקזת מהר ודורשת השקיה תכופה יותר; קרקע חרסיתית שומרת מים ודורשת מרווחים גדולים יותר. שימוש במערכת טפטוף אוטומטית עם טיימר יכול להבטיח השקיה סדירה וחסכונית. זכור: פחות מים עדיף מרוב, תפוח סובל יותר מעודף מים מאשר מחוסר, כשהוא בוגר.
