הקישוא הצהוב (Cucurbita pepo var. recticollis) מותקף בעיקר על ידי כנימות עלה, אקריות (קרדית), זבוב לבן, וכנימות קמחיתיות. הכנימות מופיעות כנקודות קטנות ירוקות או שחורות על צדו התחתון של העלה, וגורמות לעיוות עלים ולהפרשת טל דבש שמעודד פטריית פיח. האקריות גורמות להצהבה וכתמים חומים על העלים, ולרוב מופיעות בתנאי יובש. הזבוב הלבן נראה כעש זעיר לבן ומפריש אף הוא טל דבש. מניעה אורגנית כוללת ריסוס במי סבון עדינים (כף סבון כלים נוזלי בליטר מים) כל 3 עד 5 ימים, והחדרת טורפים טבעיים כמו כנימת המחנק או צרעת אכילס.
מחלות פטרייתיות נפוצות הן טחב אבקתי (כתמים לבנים קמחיים על העלים) וטחב פלומתי (כתמים צהובים-חומים עם ציפוי אפור בתחתית). שתיהן פוגעות בהטמעה ומחלישות את הצמח. טחב אבקתי מופיע בעיקר באביב ובסתיו בלחות גבוהה, וטחב פלומתי בקיץ חם ולח. טיפול אורגני: ריסוס בתמיסת סודה לשתייה (כפית סודה לשתייה + כפית שמן צמחי בליטר מים) פעם בשבוע, או ריסוס בחלב מדולל (1:9 עם מים). חשוב להקפיד על אוורור בין הצמחים ולהימנע מהרטבת העלים בערב.
ריקבון חום של הפרי (ריקבון סופו) נגרם על ידי פטריית Fusarium או Rhizoctonia, ומופיע ככתם חום רטוב שמתפשט במהירות. הגורם העיקרי הוא רטיבות מתמדת על הפרי והאדמה. מניעה: השקיה בטפטוף או השקיה ישירה לשורשים, הימנעות מהשקיית יתר, והרחקת פירות מהאדמה באמצעות קש או רשת. אם מופיע ריקבון, יש להסיר את הפירות הנגועים מיד ולשפר את הניקוז.
מזיקים פחות נפוצים כוללים תריפס (כתמים כסופים על העלים) וחיפושית הקישוא (חורים בעלים). נגד תריפס ניתן לרסס בתמצית שום (שן שום כתושה בליטר מים, סינון וריסוס). חיפושית הקישוא נאספת ידנית בבוקר. זכרו: לעולם אל תשתמשו בחומרי הדברה כימיים מבלי לקרוא את התווית ולפעול לפי ההוראות. גידול בריא ומאוזן, עם דישון אורגני, השקיה סדירה ומרווחים מתאימים, הוא ההגנה הטובה ביותר.
