דלעת ספגטי זקוקה להשקיה סדירה ועמוקה לאורך כל עונת הגידול, במיוחד בקיץ הישראלי הלוהט. התדירות המומלצת היא השקיה כל 2 עד 3 ימים בקיץ, ובאביב או בסתיו המתון, כל 4 עד 5 ימים. בכל השקיה יש לתת כמות מים שתחדור לעומק של 20 עד 30 ס"מ לפחות, כ-5 עד 10 ליטרים לצמח בוגר, תלוי במרקם הקרקע ובתנאי האקלים.
בחורף, כשהטמפרטורות נמוכות והצמח נמצא בתרדמת יחסית, יש לצמצם השקיה לפעם בשבוע-שבועיים בלבד, ורק אם הקרקע יבשה לחלוטין בעומק. השקיית יתר בחורף עלולה לגרום לריקבון שורשים ופטריות. מומלץ להשקות בבוקר או בשעות אחר הצהריים המאוחרות כדי למנוע אידוי מיותר ולאפשר לעלים להתייבש לפני הלילה.
סימני חוסר מים: עלים נבולים בשעות החמות, צמיחה איטית, פירות קטנים או מעוותים. לעומת זאת, עודף מים מתבטא בעלים צהובים, כתמים חומים, ריח רע מהקרקע או עובש על פני המצע. כדי לבדוק רטיבות, הכנס אצבע לעומק של 5 עד 7 ס"מ; אם האדמה לחה, דחה את ההשקיה. השקיה בטפטוף או צינור מחורר עדיפה על פני ממטרה, שכן היא שומרת על העלים יבשים ומפחיתה מחלות.
בתקופת הפרי, כשהדלעות מתפתחות, הקפד על השקיה סדירה, חוסר מים גורם לפירות מרים או לא מפותחים. עם זאת, כשבוע-שבועיים לפני הקטיף המומלץ, צמצם את ההשקיה כדי להעשיר את טעם הפרי ולמנוע סדקים. השקיה מוגזמת לקראת קטיף עלולה לגרום לדלעת להיות מימית וחסרת טעם.
