השקיית מנגו תלויה בעונה ובגיל העץ. בקיץ הישראלי החם (מאי-אוקטובר), השקה עץ בוגר אחת ל-5 עד 7 ימים בכמות של 40 עד 60 ליטר לכל השקיה (תלוי בגודל העץ ובסוג הקרקע). בקרקע חולית יש להשקות בתדירות גבוהה יותר (כל 3 עד 4 ימים) ובכמות מעט קטנה יותר, בעוד שבקרקע כבדה יש להרחיב את המרווחים ל-7 עד 10 ימים. עצים צעירים (שנה-שנתיים) זקוקים להשקיה תכופה יותר, פעמיים בשבוע בקיץ, 15 עד 20 ליטר בכל פעם.
בחורף (נובמבר-פברואר) יש לצמצם משמעותית את ההשקיה. השקה עץ בוגר אחת ל-2 עד 3 שבועות, ורק אם לא ירד גשם משמעותי. עצים צעירים דורשים השקיה אחת לשבוע-שבועיים. חשוב להימנע מהשקיית יתר בחורף, העלולה לגרום לריקבון שורשים. הפסק לחלוטין השקיה כחודש לפני הפריחה (בסוף החורף) כדי לעודד פריחה אחידה.
סימנים לעודף מים: עלים מצהיבים, נשירת עלים, כתמים חומים בשולי העלה, וריקבון בשורשים (ריח רע מהקרקע). סימנים לחוסר מים: נבילת עלים בשעות החמות, עלים מסולסלים, יבול קטן ופרי שנושר בטרם עת. בדוק רטיבות המצע על ידי החדרת אצבע לעומק 10 עד 15 ס"מ, אם האדמה יבשה במגע, הגיע זמן ההשקיה.
השקה תמיד בבסיס הגזע, לא על העלים או הגזע עצמו, כדי למנוע מחלות פטרייתיות. השתמש בהשקיה איטית (טפטוף או הצפה איטית) כדי שהמים יחדרו לעומק השורשים. כרך את הקרקע סביב העץ בשכבת קומפוסט או חיפוי אורגני (5 עד 10 ס"מ) לשמירת לחות והפחתת תדירות ההשקיה. בקיץ, השקה בשעות הבוקר המוקדמות או הערב המאוחרות כדי להפחית אידוי.
