בצל ירוק (Allium fistulosum) הוא צמח עמיד יחסית, אך גם הוא מותקף לעיתים על ידי מזיקים ומחלות. האקלים הישראלי, עם הלחות הגבוהה בחלק מהאזורים והחום בקיץ, מהווה כר פורה לבעיות פטרייתיות ומזיקים. זיהוי מוקדם הוא המפתח לטיפול מהיר ויעיל, מבלי לפגוע בצמח או בסביבה.
בין המזיקים הנפוצים תמצאו כנימות (בעיקר כנימת עלה) המופיעות כמושבות דביקות על העלים הצעירים. הן מחלישות את הצמח ומפרישות טל דבש שעלול לגרום לפטריית פיח. טיפול אורגני פשוט: ריסוס במים עם סבון כלים עדין (כפית סבון נוזלי לליטר מים) פעם ב-3 ימים למשך שבוע. אפשר גם לשטוף את הכנימות בזרם מים חזק. אקריות (קרדית) גורמות לעיוות עלים ולכתמים כסופים; נגדן מרססים בתמיסת שמן נים (5 מ״ל לליטר מים) פעם בשבוע.
מחלות פטרייתיות כמו ריקבון שורש (Fusarium) או טחב פלומתי (Peronospora) נפוצות בעיקר בעונות המעבר ובחורף. ריקבון שורש מתבטא בהצהבת עלים מבסיס הצמח וריח רע מהשורשים. טחב פלומתי מופיע ככתמים צהובים-חומים עם נבגים אפורים בצד התחתון של העלה. מניעה: השקיה בטפטוף (לא ממטרה), שתילה במצע מנוקז היטב, ומרווחים של 10 ס״מ בין צמחים לאוורור. לטיפול בטחב פלומתי אפשר לרסס בתמיסת סודה לשתייה (1 כפית לליטר מים) פעם בשבוע.
מחלת ריקבון רך (Erwinia) נגרמת מחיידק ומופיעה ככתמים מימיים ורכים על העלים, בעיקר בחום ולחות. יש להסיר מיד עלים נגועים ולהימנע מהשקיית יתר. כטיפול אורגני אפשר לפזר קומפוסט עשיר בחיידקים מועילים סביב הצמח. זכרו: בצל ירוק רעיל לכלבים וחתולים (מכיל תיוסולפט), לכן הרחיקו חיות מחמד מהצמח ומהטיפולים.
