מלון ירוק זקוק להשקיה סדירה לאורך כל עונת הגידול, אך הכמות והתדירות משתנות בהתאם לשלב ההתפתחות ולעונה. בישראל, זורעים אותו באביב (מרץ-אפריל) והוא מבשיל בקיץ (יולי-אוגוסט). בשבועיים הראשונים לאחר הזריעה, השקה כל 2 עד 3 ימים בכמות של כ-2 עד 3 ליטר למ"ר, כדי לשמור על לחות קבועה ולהבטיח נביטה אחידה.
משלב הפריחה ועד להבשלה (מאי-יוני), הצמח זקוק ליותר מים, השקה כל 3 עד 4 ימים בכמות של 5 עד 7 ליטר למ"ר. בקיץ הישראלי החם (יולי-אוגוסט), ייתכן שתצטרך להשקות כל 2 עד 3 ימים, תוך התאמה לטמפרטורות גבוהות (מעל 35°C) ולרוחות יבשות. השקה תמיד בשעות הבוקר המוקדמות כדי למנוע אידוי מוגבר ומחלות פטרייתיות.
ככל שהפרי מתקרב להבשלה (כשבועיים לפני הקטיף), הפחת בהדרגה את ההשקיה, השקה פעם ב-5 עד 7 ימים בכמות של 3 עד 4 ליטר למ"ר. הפחתה זו מעלה את ריכוז הסוכרים בפרי ומשפרת את טעמו. הימנע מהשקיית יתר בתקופה זו, כי היא עלולה לגרום לריקבון הפרי ולסדקים בקליפה.
סימני חוסר מים: עלים נבולים בשעות הצהריים, צמיחה איטית, פירות קטנים ומרים. סימני עודף מים: עלים מצהיבים, ריקבון שורשים, פירות מימיים וחסרי טעם. כדי לבדוק רטיבות, החדיר אצבע לעומק 10 ס"מ באדמה, אם האדמה יבשה, השקה; אם לחה, המתן. שימוש בחיפוי (קש, קומפוסט) סביב הבסיס יעזור לשמור על לחות אחידה.
