נקטרינה היא עץ נשיר שזקוק לדשן מאוזן ועשיר באשלגן וזרחן, במיוחד בעונת הפרי. הדישון הראשון בשנה כדאי לבצע בסוף החורף (פברואר-מרץ), סמוך להתנצת, באמצעות דשן אורגני כמו קומפוסט או זבל עוף מותסס. כמות מומלצת: 5 עד 10 ק"ג לעץ בוגר, לפזר מתחת לכושר ההצללה ולשלב קלות באדמה. הימנע מדישון חנקני כבד בשלב זה, שכן הוא מעודד צמיחת עלווה על חשבון הפרי.
בתקופת הפריחה וההבשלה (אפריל-יוני), יש להעדיף דשן נוזלי אורגני (כגון תחליב אצות או דשן נוזלי על בסיס דגים) בריכוז חצי מהמומלץ, אחת לשבועיים. אם משתמשים בדשן כימי מאוזן (NPK 10 עד 10 עד 10 או 12 עד 12 עד 12), יש לפזר כ-200 עד 300 גרם לעץ בוגר בחודש אפריל, ולחזור על הפעולה בחודש יוני. השקיה לאחר הדישון חיונית כדי למנוע כוויות שורשים.
דישון חנקני (NPK עם יחס חנקן גבוה, כמו 20 עד 10 עד 10) עלול לגרום לצימוח מוגזם של עלים, רגישות למחלות (למשל טחב אבקתי) ופרי מימי וחסר טעם. לכן עדיף דשן אורגני איטי-שחרור או דשן כימי עם יחס חנקן נמוך יותר. כמו כן, הקפד על דישון אשלגן (K) גבוה לקראת סוף העונה (יולי-אוגוסט), למשל אשלגן גופרתי (0 עד 0-50) בכמות 50 עד 100 גרם לעץ, לחיזוק טעם הפרי והארכת חיי המדף.
בסתיו (אוקטובר-נובמבר), לאחר קטיף הפרי, יש לדשן בזבל אורגני (קומפוסט או זבל פרות) על מנת להכין את העץ לתרדמת החורף. כמות: 5 עד 10 ק"ג לעץ, לכסות בשכבת מאלץ' אורגני (למשל קליפות עץ או גזם) כדי להגן על השורשים ולשפר את מבנה הקרקע. הימנע מדישון חנקני בסתיו, שכן הוא עלול לעודד צמיחה חדשה שתפגע מקור החורף.
