במהלך תקופת הריבוד הקר, בדקו מדי שבוע שהמגבת עדיין לחה ואין עובש. לאחר 8-12 שבועות, סדקו בעדינות את קליפת הגלעין בעזרת מפצח אגוזים או צבת – היזהרו לא לפגוע בעובר שבתוכו. שתלו את הגלעין בעומק 1-2 ס"מ בעציץ קטן (קוטר 10 ס"מ) עם מצע מנוקז היטב – תערובת של כבול, פרלייט וקומפוסט ביחס 2:1:1. השקו בעדינות והניחו במקום מואר היטב אך ללא שמש ישירה, בטמפרטורת חדר (20-25 מעלות).
הנביטה צפויה תוך 2-4 שבועות מהשתילה. הזמן הכולל מהכנת הגלעין ועד הופעת הנבט הוא כ-3-5 חודשים (כולל הריבוד הקר). לאחר שהנבט מוציא 2-3 עלים אמיתיים, העבירו לעציץ גדול יותר (קוטר 15-20 ס"מ) והמשיכו לגדל במקום מואר. דובדבן הגדל מזרע ייקח 5-7 שנים עד לפרי ראשון, והפרי לא יהיה זהה לפרי המקורי. בישראל, מומלץ לשתול באדמה רק לאחר שנה-שנתיים, באזור קריר יחסית (הר או עמק) ובחפיפה עם חורף.
חשוב לדעת: רוב זני הדובדבן דורשים האבקה צולבת, כך שעץ יחיד מזרע לא יניב פרי ללא עץ נוסף מזן אחר בקרבתו. לכן, לגידול ביתי בעציץ, כדאי לשקול זנים מושתלים או ננסיים. אם בכל זאת בחרתם בזרע, התאזרו בסבלנות – העץ יהווה צמח נוי יפה, אך הפרי אינו מובטח.