גם תאורה לקויה גורמת לצמח להיחלש. בזיליקום לימוני זקוק ל-6–8 שעות שמש ישירה ביום. בישראל, חלון דרומי או מערבי הוא אידיאלי. אם הצמח נראה מוארך ועלים קטנים, העבירו אותו למקום מואר יותר, אך הימנעו משמש צהריים קופחת בקיץ (הצלילו בשעות 12:00–15:00). באביב ובסתיו, אפשר להשאיר אותו בחוץ במרפסת. אם אין אור טבעי מספק, השתמשו בנורת לד לגידול במרחק 15–20 ס"מ מהצמח למשך 12 שעות ביום.
גיזום הוא חלק קריטי בתהליך. חתכו את כל העלים והגבעולים הצהובים, החומים או הרקובים – הסירו עד 70% מהמסה הירוקה אם צריך, אבל השאירו לפחות שני זוגות עלים על כל ענף חי. גזמו בזווית של 45° מעל נקבה (מקום שממנו צומחים עלים) כדי לעודד צמיחה חדשה. לאחר הגיזום, השתילו מחדש בעציץ נקי עם ניקוז טוב ובמצע חדש ומנוקז (תערובת של 60% כבול/קוקוס ו-40% פרלייט או חול). השקו פעם אחת מיד לאחר ההשתלה, ואז המתינו שהאדמה תתייבש לפני ההשקיה הבאה.
אל תצפו לנס בין לילה. התאוששות מלאה אורכת 2–4 שבועות בישראל באביב או בסתיו, ו-4–6 שבועות בחורף (הצמח נכנס לתרדמת איטית). בקיץ, עם טיפול נכון, תראו עלים חדשים תוך 7–10 ימים. במהלך ההתאוששות, השקו רק כשהאדמה יבשה בעומק 2 ס"מ, ודשנו פעם בשבועיים בדשן נוזלי מאוזן (10-10-10) מדולל לחצי ריכוז. הימנעו מדישון בחורף. אם הצמח לא מראה סימני חיים תוך חודש, סביר להניח שהשורשים נפגעו ללא תקנה – אז כדאי להתחיל ייחור מעלה בריא.