בחירת העציץ המתאים היא צעד ראשון קריטי. לשתיל לימון צעיר (גובה 30 עד 60 ס"מ) התחילו עם עציץ בקוטר 20 עד 25 ס"מ. ככל שהעץ גדל, העבירו אותו לעציץ גדול יותר, כל 2 עד 3 שנים, בהדרגה, עד לעציץ סופי בקוטר 50 עד 60 ס"מ (נפח של כ-40 עד 60 ליטר). עציץ גדול מדי בהתחלה עלול לגרום לריקבון שורשים כי עודפי מים לא מתנקזים. הקפידו על חורי ניקוז בתחתית ושכבת ניקוז של חלוקי נחל או חצץ בגובה 3 עד 5 ס"מ.
המצע האידיאלי ללימון חייב להיות מנוקז היטב, מעט חומצי (pH 5.5 עד 6.5) ועשיר בחומר אורגני. הרכב מומלץ: 2 חלקים אדמת גינה או טוף עדין, 1 חלק כבול או קומפוסט, וחלק אחד פרלייט או חול גס. בעציצים, השתמשו בתערובת ייעודית להדרים או ערבבו בעצמכם. הימנעו מאדמת חרסית כבדה או מצע ששומר מים יתר על המידה. בעת השתילה, מלאו את העציץ עד חצי, הניחו את השתיל כך שצוואר השורש (המקום בו הגזע פוגש את השורשים) יהיה בגובה פני המצע, והשלימו את המילוי תוך כדי הידוק קל.
העיתוי המושלם לשתילה ולהעברת עציץ הוא באביב (מרץ-מאי) או בתחילת הסתיו (ספטמבר-אוקטובר), כשהטמפרטורות מתונות והעץ אינו בתקופת פריחה או חנטה פעילה. הימנעו משתילה בקיץ החם או בחורף קר. לפני ההעברה, השקו את העץ היטב יום קודם כדי שהשורשים יהיו גמישים. הוציאו בעדינות את העץ מהעציץ הישן, שחררו שורשים מסתובבים בתחתית, וגזמו שורשים פגומים או מתים. הניחו את העץ במרכז העציץ החדש באותו עומק שהיה קודם.
טיפול אחרי השתילה: מיד לאחר השתילה, השקו בשפע עד שהמים יוצאים מחורי הניקוז. בשבועיים הראשונים השקו כל 2 עד 3 ימים, תלוי במזג האוויר, כדי לשמור על לחות אחידה אך לא רטובה. דשן ראשון אפשר לתת רק לאחר חודש, עם דשן מאוזן להדרים (לפי הוראות היצרן). הקפידו על חשיפה לשמש מלאה (לפחות 6 עד 8 שעות ביום). בשבועות הראשונים הגנו על העץ מרוחות חזקות. אם מופיעים עלים מצהיבים, זה נורמלי, העץ מסתגל. גיזום לא נדרש בשלב זה, אלא רק הסרת ענפים יבשים.
