השיטה הבטוחה ביותר לניקוי קקטוס כדורי היא שימוש במברשת רכה ויבשה (כמו מברשת איפור נקייה או מברשת צבע רכה). העבירי בעדינות את המברשת על פני כל הגוף הירוק, בין הקוצים, כדי להסיר אבק. הימנעי מלגעת בקוצים בידיים חשופות – לבשי כפפות עבות או השתמשי במלקחיים כדי להחזיק את המברשת. אין צורך להשתמש במים או בחומרי ניקוי – מים עלולים להישאר בין הקוצים ולגרום לריקבון.
אם יש כתמים עיקשים (למשל משקעי מים קשים), אפשר להרטיב מעט מטלית רכה במים מזוקקים או מסוננים, ולנגב בעדינות את האזור המלוכלך. חשוב לוודא שהצמח יבש לגמרי אחרי הניקוי – הניחי אותו במקום מאוורר ומוצל למספר שעות. לעולם אל תשתמשי בחלב, שמן זית, חומרי הברקה או כל מוצר שמן – הם סותמים את הנקבוביות ועלולים לגרום לכוויות שמש או ריקבון.
בנוסף לניקוי העלים, כדאי לנקות גם את העציץ והאדמה מאבק ולכלוך. אחת לשנה, בעונת האביב, אפשר להעביר את הצמח למקלחת עדינה עם מים פושרים (לחץ נמוך) כדי לשטוף אבק עקשן, אך רק אם האדמה יבשה והטמפרטורה מעל 20 מעלות. לאחר המקלחת, יבשי היטב את הצמח בעזרת מטלית רכה והחזירי אותו למקומו הקבוע רק כשהוא יבש לחלוטין.