הבואי, בצל הנוי המטפס, נחשב לצמח עמיד יחסית, אך הוא אינו חסין לחלוטין מפני מזיקים ומחלות. המזיקים הנפוצים ביותר הם כנימות עלים (Aphids) ואקריות (Spider mites), במיוחד בתקופת האביב והקיץ היבש. הכנימות מופיעות כנקודות קטנות ירוקות או שחורות על העלים הצעירים והגבעולים, ואילו האקריות יוצרות קורים דקים וכתמים צהבהבים על פני העלה. זיהוי מוקדם הוא המפתח לטיפול מהיר ויעיל.
לטיפול אורגני בכנימות, יש לרסס בתמיסת סבון רך: כפית אחת של סבון כלים נוזלי (עדיף אורגני) בליטר מים, ולרסס היטב על האזורים הנגועים. חזור על הפעולה כל 3 עד 4 ימים עד להיעלמות הכנימות. נגד אקריות, שטיפה חזקה של העלים במים פושרים יכולה להפחית את האוכלוסייה, ולאחר מכן ריסוס בתמיסת שמן נים (Neem oil) בריכוז 1:100 (10 מ"ל שמן נים בליטר מים עם טיפת סבון) יעיל מאוד. יש לרסס בשעות הערב המאוחרות כדי למנוע צריבה.
המחלה העיקרית הפוגעת בבואי היא ריקבון שורשים ובצל (Root and bulb rot), הנגרם על ידי פטריות קרקע כמו Fusarium ו-Pythium. הסיבה העיקרית היא השקיית יתר או ניקוז לקוי. סימני האזהרה: עלים מצהיבים, רכות בגזע, וריח רע מהאדמה. במקרה של ריקבון, יש להפסיק מיד את ההשקיה, להוציא את הצמח מהעציץ, לגזור את החלקים הרקובים בעזרת סכין סטרילית, ולשתול במצע חדש ומנוקז היטב (תערובת 2:1:1 של אדמה, פרלייט וחול גס). פטרייתית עלים (Leaf spot) נדירה יותר, ומופיעה ככתמים חומים עם הילה צהובה, יש להסיר עלים נגועים ולשפר אוורור.
מניעה היא הדרך הטובה ביותר: הקפד על ניקוז מצוין, השקה רק כשהמצע יבש בעומק 3 עד 4 ס"מ, ושמור על רווח בין צמחים לאוורור טוב. הימנע מהרטבת העלים בזמן השקיה. בדוק את הצמח מדי שבוע לאיתור מזיקים, במיוחד בצד התחתון של העלים. אם מזיקים חוזרים שוב ושוב, ניתן להשתמש בחומר ביולוגי כמו טורפים טבעיים (למשל, מושית השבע נגד כנימות), אך יש לרכוש ממשתלה מורשית. חשוב: אין לרסס בקוטלי חרקים כימיים ללא הכוונה מקצועית, קרא תמיד את התווית.
