נר הלילה (Oenothera biennis) הוא צמח עמיד יחסית, אך בתנאי גידול לא מיטביים עלולים להופיע מזיקים ומחלות. המזיקים הנפוצים בישראל הם כנימות, אקריות (קרדית עכביש), זבוב לבן ולעיתים תריפסים. המחלות העיקריות הן ריקבון שורשים (הנגרם מפטריות כמו פיתיום וריזוקטוניה) ועובש אפור (Botrytis). זיהוי מוקדם וטיפול אורגני ימנעו נזק כבד.
כנימות: מופיעות כמושבות קטנות על נצרים צעירים, בצד התחתון של עלים וניצנים. הן מפרישות טל דבש שעליו מתפתחת פטריית פייחת. טיפול: ריסוס בתמיסת סבון אשלגן (20 מ"ל לליטר מים) או שמן נים (5 מ"ל לליטר). חזור כל 5 עד 7 ימים. למניעה, משך חרקים מועילים כמו כנפיים ירוקות וצרעות טפיליות.
אקריות (קרדית עכביש): מופיעות בחום יבש, עלים מצהיבים וקורים דקים. טיפול: הגברת לחות (ערפול מים), ריסוס בשמן נים או תמיסת גופרית רטובה (לפי הוראות היצרן). הימנע מריסוס בשעות החום הכבד. זבוב לבן: קטן, לבן, מעופף. טיפול: מלכודות דבק צהובות, ריסוס בסבון אשלגן או שמן נים. תריפסים: עלים כסופים, עיוותים. טיפול: ריסוס בשמן נים או תמצית שום.
מחלות: ריקבון שורשים נגרם מהשקיית יתר או ניקוז לקוי. סימנים: עלים נבולים, גבעולים רכים, ריח רע מהשורשים. טיפול: הפסק השקיה מיד, יבש את האדמה, גזור שורשים רקובים והעבר לאדמה חדשה ומנוקזת. למניעה, השקה רק כשהשכבה העליונה יבשה. עובש אפור (Botrytis): כתמים חומים על עלים ופרחים, עם נבגים אפורים. טיפול: הסר חלקים נגועים, אוורר את הצמח, ריסוס בתמיסת סודה לשתייה (1 כפית לליטר). לרוב מופיע בלחות גבוהה, אוורור הוא המפתח.
